Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms