Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EDIL3O43854 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EDIL3O43854 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms