Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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