Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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