Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms