Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms