Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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