Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms