Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms