Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED16Q9Y2X0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms