Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms