Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED23Q9ULK4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms