Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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