Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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VAPAQ9P0L0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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