Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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HOXC10Q9NYD6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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HOXC10Q9NYD6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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