Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms