Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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TDP1Q9NUW8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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TDP1Q9NUW8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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