Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRDM9Q9NQV7 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRDM9Q9NQV7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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