Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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LHX9Q9NQ69 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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