Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms