Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms