Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms