Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USB1Q9BQ65 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USB1Q9BQ65 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USB1Q9BQ65 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USB1Q9BQ65 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USB1Q9BQ65 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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