Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN10Q96LJ8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN10Q96LJ8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN10Q96LJ8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN10Q96LJ8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms