Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms