Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP47Q96K76 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms