Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCE1Q969G3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms