Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms