Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf40Q8IXQ3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms