Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms