Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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