Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms