Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms