Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms