Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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