Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYTH1Q15438 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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