Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PUM3Q15397 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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