Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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RAB3GAP1Q15042 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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