Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRQ13535 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRQ13535 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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