Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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MKRN4PQ13434 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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