Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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ITGB3BPQ13352 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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ITGB3BPQ13352 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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