Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP140Q13342 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP140Q13342 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP140Q13342 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP140Q13342 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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