Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms