Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RLFQ13129 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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