Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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