Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms