Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms