Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms