Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTBN1Q01082 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms