Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAT1AQ00266 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms